中科院物理研究所和高能所，都是中科院的研究所。研究方向不同，不存在那个厉害。都是国内顶级科研单位。

中国科学院高能物理研究所是中国从事高能物理研究、先进加速器物理与技术研究及开发利用、先进射线技术与应用的综合性研究基地。其前身是创建于1950年的中国科学院近代物理研究所，后改称物理研究所、原子能研究所。1973年2月，根据周恩来总理的指示，在原子能研究所一部的基础上组建高能所。