高等工程学院是北京航空航天大学（以下简称北航）下属的一个学院。
为了进一步提高本科生的教育质量，培养在国防科技和国民经济建设方面相关学科的帅才，将才和拔尖人才，北航于2002年9月成立了高等工程学院。首届学生由当年录取的优秀新生中选拔，经过数学，物理，英语考试及心理，非智力因素测试和专家面试，在3500名新生中吸收了34名，生源分布在 电子，计算机，自动化，动力及航空，航天等八个院系。
   高等工程学院以理工结合，加强和拓宽基础，注重人文素质的培养和个性化培养为宗旨只负责大学一二年级的基础课程。两年中侧重学习数学分析，高等代数，数学建模，数理逻辑，概率统计，大学基础物理， 基础生命科学，大学语文及中西方哲学史讲座（以上课程基本上按北京大学要求，并聘请该校资深博士导师或教授小班讲课），以及理论力学，材料力学，化学，电路分析，模拟电路，数字电路（以上六门按不同方向任选四门)等12门核心课程。大一结束即要求学生通过国家英语四级（周学时为6，中学已过者可免修），从 二年级起分两小班（每班不超过20人）由外籍教师进行听，说，读，写的强化训练。
   从一年级下学期开始为每个学生聘请一位专职导师，导师均为中国科学院，中国工程院院士或我校资深博导及长江学者，首批学员已于2003年4月11日举行拜师大会及新闻发布会 。每名学生由导师安排学习计划，适时进入相关的实验室，参与导师从事的科研项目及社会活动，外事活动等。凡具备条件及自愿读硕士，博士者，将由学校特殊批准。两年中凡核心课程不及格，经补考仍未通过者将退回原所在专业就读。
   高等工程学院院长由我校校长李未兼任，常务副院长为副校长郑志明兼任，副院长侯安平全面负责工作，资深顾问钱士湘，全面配合侯安平工作，直属党支部书记陈新，负责党建和学生工作。两年中学院单独编班，集中住宿，不另收附加学费。