教育硕士专业学位有自己特殊的质的规定性，科学地认识教育硕士的专业性质是避免与教育学硕士雷同，充分发挥其应有功能，全面为基础教育服务的必然要求。具体说，教育硕士的专业性质主要体现在实务性、封闭性和复合性三个方面。
1、实务性
教育硕士是以培养学术型的高级专门教育人才为目的的，而教育硕士则以培养实务型高级专门教育人才为目标。两者虽然都是教育的硕士研究生，但“研究”的指向是不一样的。前者指向的是教育科学、教育理论，是学术研究(academicresearch)，并以提出或创造新的教育理论为旨趣;后者指向的是教育工程、教育实践，是行动研究(actionresearch)，以解决实际存在的教育、教学和管理问题为目的。研究指向的不同使教育学硕士具有了鲜明的学术性质或科学性质，而教育硕士则带有实务性质或工程性质。
教育硕士专业学位的实务性质决定论它在课程组织、教学方式、师资结构等方面的特殊规定。首先在课程组织上，教育硕士注重课程内容的实用性、微观性和实证性，是以有助于分析和解决基础教育面临的实际问题为标准来组织的，对于严重脱离生动活泼教育实际的内容，譬如《教育学原理》中有关教育学逻辑起点、教育学理论体系、分析教育哲学以及教育语言学等都要提出在课程之外。其次在教学方式上，教育硕士在重视理论讲授、课堂讨论的同时，更加强调案例教学和行动学习环节的重要作用。案例教学是沟通理论与实践的桥梁，通过典型案例的分析、研究与讨论，来培养和提高研究生分析问题与解决问题的能力。行动学习是一种以研究生为中心，由他们主动提出中小学教育、教学和管理上的实际问题，并由全体研究生共同研究解决问题方案的一种教学方式，它对培养研究生独立地发现、研究与解决实际问题的能力是十分有益的。最后在师资结构上，培养教育硕士的师资队伍是混合型的，它除了要求教师有一定的学术水平外，更强调教师要有较丰富的教育实践经验;除了有大学全职教师外，还有来自中小学教育、教学和管理第一线的校长、名师和名家作兼职教师。
2、封闭性
无论从招生来源还是毕业去向上看，教育学硕士都是多元的。就招生来源而言，既有来自同专业的大学本科应届生，也有不同专业的大学本科应届生;既有来自中小学教学和管理第一线的在职人员，也有来自高校、企业和教育行政机关的在职人员。就毕业去向而言，既有到教育科研机构从事教育科学研究的，也有到高校从事教育科学教学的;既有到中小学从事教育、教学和管理的，也有到非教育部门工作的。相比较而言，教育硕士的招生来源和毕业去向却比较单一，是一元的。从招生来源上看，主要是具有大学本科学历、具有三年以上实际工作经历的中小学教育、教学和管理人员。从毕业去向上看，他们要全部回到基础教育第一线从事教育、教学和管理工作，遵循“哪来哪去”的原则。来源和去向的不同使教育学硕士具有了开放性质或非定向性质，而教育硕士则有着封闭性质或定向性质。
在许多国家，教育硕士的生源除了来自中小学教育实践第一线外，还有相当比例来自已获得了与中小学任教科目相关的文理科学士学位的应届毕业生。教育硕士招生来源的封闭性是我国的一个特殊，而且是应该坚持的一个特色，这种封闭性将有助于加深生源对中国基础教育实际的了解，体现学位的实务性和职业性。在就业去向上，世界各国基本上都是一致的，但在待遇上是不同的。在发达国家，教育硕士到基础教育部门工作并没有什么特殊的优惠待遇(有时也随教师市场供求的变化而有相应的政策改变)，但在我国，我们建议能有所区别，至少在发展教育硕士专业学位的最初阶段应该是这样。因为这样将体现对教师职位而非教师个人的尊重，体现对高素质教师而非一般教师的关怀，从而建立一种激励机制，促进教师主动、自觉地提高自身的素质，进而实现由“学而优则仕”、“学而优则商”向“学而优则师”的转变。
3、复合性
就专业性质而言，教育学硕士(包括学科教学论)各专业是同质的，其课程组合基本都是围绕单一性质的专业而排列的。譬如教育学原理专业，大致要开设《教育学原理导论》、《德育原理》、《教育科学研究方法》、《教育心理学》、《世界教育理论与教育改革》以及《中国教育热点与改革》等课程，学科教学论也是如此。与此相对，教育硕士却是异质的，其课程组合要围绕多重性质的专业需求而排列。以学科教学论(中文教育)为例，除了开设《教育学原理》、《教育心理学》、《教育科技学》、《教育研究方法》和《青少年心理学》等教育性课程之外，还开设诸如《语文教育论》、《语文发展教育史》、《语文教育改革与研究》和《汉语言文学研究》、《中国文化概括》等学科性课程。专业性质的差异使教育学硕士有着强烈的单科性质或一象性质，而教育硕士则具有着复合性质或二象性质，它是教育性与学科性双重属性的有机统合。
教育硕士专业学位的复合性质是其他专业学位所不具备的特殊属性。在传统的教师教育中，中文系培养了一批作家，却很少出现语文教育家，数学系培养了一批数学家，也很少出现数学教育家，这都是对教育硕士的复合性缺乏必要认识所造成的恶果。实际上，早在20世纪30年代，美国哈佛大学校长科南特就指出了教育硕士是一种跨学科的学位，具有一定的复合性质。我们认为，现在问题的关键已不是争论教育硕士的属性是单科性还是复合性，而是两科以什么样的比例配置才能培养出教育家以及如何避免配置的机械性，增加有机性。