(四)加强会计核算,规范资金拨付和账务处理程序   
高校基建财务应并入校级财务中,在基建财务中完整设立会计科目及明细账,科目明细级数设置应以满足会计核算的需要为原则,过细过粗均不宜。高校基建会计科目应按三级明细科目设置,即一级对应总账科目,二级对应工程项目名称,三级对应项目的承建单位名称。在高校基建会计核算中,除开设了银行辅助账户后需设“银行存款”科目外,还需设置如下一些基本科目:“建安工程投资”、“库存材料”、“预付工程款”、“预付备料款”、“待摊投资”、“设备投资”、“应收账款”、“应付账款”、“应付工程款”、 “应付器材款”、“其他应收款”、“其他应付款”、“基建拨款”和“交付使用资产”等科目。  
严格规范资金的拨付程序:1.工程款支付基本程序为:施工方申请→监理工程师审核签字→跟踪审计工程师审核签字→甲方代表审核签字→基建处工程科长审批→基建处分管工程的处领导审批→财务处分管基建的处领导审批→审计处领导审批(规定限额以上资金)→分管基建的校领导审批(规定限额以上资金)→基建财务部门付款→反馈信息;2.材料款和设备款支付基本程序为:材料和设备供应商申请→监理工程师审核签字→跟踪审计工程师审核签字→材料员审核签字→基建处材料科长审批→基建处分管材料的处领导审批→财务处分管基建的处领导审批→审计处处领导审批(规定限额以上资金)→分管基建的校领导审批(规定限额以上资金)→基建财务部门付款→反馈信息。   
同时,要在工程项目初期、中期和后期三个环节规范好基建工程项目的账务处理程序,特别是对于项目的账务后期结算要重点进行规范。如对已经完工并达到“预定可使用状态”的资产,要及时办理估价入账手续。估价入账不能根据“建安工程投资“和”待摊投资“两部分,而应根据工程合同的建造价值加合同变更价以及自营工程发生的物资成本、借款利息、人工成本等对项目完工工程进行账务结转。基建财务人员要对已估价入账的资产进行必要的调价:达到“预定可使用状态”的在建工程,如果在完工年度内没有办理决算手续的,一旦办理了决算手续后,须按照实际成本调整原来的暂估价值。