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构建中医药数据资源结构图谱的探讨

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2014-05-15

2.2.1 DOI技术

DOI(Digital Object Identifier)由International DOI Foundation组织构造。该系统提供了一个框架,为数字环境中的数字对象分配唯一的、永久性的标识,方便该对象被管理和使用。DOI系统由4部分构成:申请DOI;创建对指定DOI对象的描述;解析系统;规则。

2.2.2 SFX技术

SFX即Special Effects Cinematography,它是比利时根特大学的萨姆堡尔为首的研究小组提出的。通过Open URL框架把复杂的数据库之间的互连通过简单的链接完成。

2.2.3 Web Services技术

Web Service是为实现“基于web无缝集成”的目标而提出的全新概念,希望通过Web Service能够实现不同的系统之间能够用“软件-软件对话”的方式相互调用,打破软件应用、网站和各种设备之间格格不入的状态。

2.2.4 地域性索引服务平台技术

A.N.ZINCIR-HEYWOOD提出一个地域性索引服务平台(Domain Index Server),建议依靠一个索引代理去创建成主要的原文献索引,这个代理通常是软件系统,能够在异构信息支撑下自动行动(搜索)的系统。

2.2.5 MAP资源整合系统

INNOPAC公司推出的MAP (Millennium Access Plus)是一个集成的资源整合系统,它可实现不同信息资源的动态链接。这些资源包括全文电子资源、题录和文摘数据库、书目数据库、图书馆在线书目系统、图像数据库及搜索引擎等其他Web资源。

2.2.6 OAI标准整合模式

OAI是指open archives initiative,它的目标是发展和促进互操作标准,促进内容数据的有效传播。①数据提供者:提供元数据的Web服务器。②服务提供者:向数据提供者发出请求并且利用得到的元数据构建增值服务。③存储体:由数据提供者管理的可以在网上访问的服务器,它提供服务提供者需要采集的元数据。④采集器:在服务提供者方作为从存储体中搜集元数据的一种应用工具。

2.2.7 情报源图谱

美国国立医学图书馆主持了一项长期研究和开发计划,即统一医学语言系统(UMLS),其项目中有一个是关于生物医学机读信息资源的情报源图谱,其目的是利用超级叙词表和语义网络实现情报源与特定提问的相关性;有效组织信息资源,为用户提供特定信息源的范围、功能和检索条件等人工可读的信息;自动连接相关信息源;在一个或多个情报源中自动检索并自动组织检索的结果[3]。

3 构建中医药数据资源结构图谱

3.1 中医药数据资源结构图谱框架(见图1)

3.2 中医药数据资源结构图谱内容

3.2.1 物理层

系统运行的硬件、软件环境,解决如何为应用系统提供统一的支撑环境,支持应用系统的运作。

3.2.2 基础层

位于物理互连的网络协议之上,用于标准化、规范化描述数据,为更上层的数据交换提供基础性支持的标准、规范。基础性协议标准又可以划分为数据描述层面和数据访问层面。前者主要包括元数据、XML、RSS,后者主要包括开放数据库互连标准(ODBC)等。在数据描述层面内部,RSS具有提供内容聚合的功能,是为实现内容聚合而制定的一种信息描述、组织的规范,但它也具有资源发现、发布的功能,更是一种新形式的描述规则。因此,将RSS归入基础的描述层面标准。准确的说,RSS本身也是基于XML格式的,其实是XML成功应用的一个典型。从这一层总体来看,这些基础的标准、规范(除了RSS之外),大多数都不是专门为解决资源整合的问题而制定的,主要是从信息组织、跨异构数据库的互连、互访用途出发的。但是,它们确为更好地实现资源整合提供了有力的支持。

3.2.3 数据层整合

旨在屏蔽各数据源异构性,使得各数据源之间能够进行数据的交换与交互,令用户可透明地访问多个数据源。要实现数据整合,必须对数据进行跨数据源的收集、组织、处理与集成。根据整合系统与数据源之间交互的特点,又可以分为3种形式:基于联邦的整合、基于采集的整合、基于链接的整合;数据层整合协议的重点是解决系统之间的数据交换和数据交互。

整合揭示以下功能。①不同文献层次、级别的指引关系:题录信息→标引信息→文摘信息→全文→结构信息,一次文献和二次文献之间的对应联系。②中心数字资源和网络数字资源之间的交叉、重复和互补关系:全文数据库与中心文献相重复的部分;又如PUBMED的生物医学资源中的期刊包括绝大多数的馆藏期刊,并提供了大部分题录和部分免费全文。③数字资源之间的主题相关或学科相关,内容上的重合和互补关系:引用和被引用及共同引用的关系,说明资源在内容上的相互关联。④数字资源与服务之间的关系:共建资源与服务资源之间存在密切联系,但因服务层次需求分为全文、结构、粗表、细表、分析表等资源。

3.2.4 具体整合要求

标签:药学论文

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