二、现代中医理论发展的非主体定向
　　1.现代中医理论处于上述从理论上应该发挥作用而实际上并未发挥作用的困惑之中。对这一现象之原因分析及解决方法探讨习惯上从三个方面进行：应用现代科技，接受实证性方法论，中医特色与优势。但在这三个方面上，现代中医理论在很大程度上已与现代科学理论同步，而问题仍未解决。这是因为这三个方面涉及的分别是形成理论的新、老方法关系，新、老方法论关系，中、西医理论关系，而未涉及这一现象的实质－－理论与经验的关系。
　　2.现代理论科学之所以具备"大"理论特征，是因为在理论与经验的关系上，理论发展具有主体性。表现在：①理论发展的目标是无止境地追求对事物内在规律的认识，其起点是这种认识的不完备性的存在。理论发展的目标、起点包含但又不局限于对经验的解释和经验提出的问题。例如：对大西洋两岸地形的相似性这一现象的解释在大陆漂移说受证实以后已完成，但大陆漂移说的内在逻辑要求把其研究扩展到海底，从而形成海底扩张说。大陆漂移说和海底扩张说的整合、统一则形成板块构造学说。而板块构造学说今后又面临着自身运动机制及运动历史两个理论问题。从狭义相对论到广义相对理论的演变则起源于把相对性原理推广于非惯性系的逻辑合理性。广义相对论更提出了引力波、光线在引力场中偏转、引力场影响时间快慢、物质场统一理论等超出当时或现在经验、实验可及范围的预测。②由于经验具有表象性和理论具有本质性，对同一事物所形成的经验知识体系和理论知识体系必然不同且以后者为判断标准。所以，理论知识体系对于经验知识体系关系的本质是改造而不是证实。例如：进化论的产生改变了生物的人为分类法。
　　3.现代中医理论研究之所以有"小"理论的困惑，是因为在理论与经验关系上，理论发展失去了主体性，成为经验的附属。①把理论发展的起点和目标局限于对经验的解释；②以经验知识体系作为取舍理论知识体系的标准，认为后者对于前者关系的本质是证实。
　　对现代中医理论研究的一贯、最高要求就是理论解释、证实经验。汇通学派的恽树珏鉴于"中医尽能愈病，总无人能以其愈病之理由喻人"而倡"若要捍卫中医，则需将其晦涩之处诠释明白，使举国皆能明了，然后能伸其说。"至当代之研究，虽所用科学技术与恽氏时代不可同日而语，但指导思想却无有出其右者。如"把中医黑箱变成白箱"，"用现代语言阐明中医科学内涵"，经络研究上"肯定现象，掌握规律，提高疗效，阐明实质"方针，控制论证明了"中医是世界科学史上的一个奇迹"，环核苷酸研究"证实了阴阳学说"，证候理论研究均称为"实质研究"，"机理研究"，"药理研究为'通里攻下法'提供了科学依据"，中医急症研究上"临床提要求，剂改走在头，全力夺高效，说明跟在后"，"宏观病理微观化"等，均是仅仅把理论作为一种说理工具。
　　在这种思想指导下，现代中医理论研究公认地在很大程度成了一种解释，证实性研究。阴阳学说研究，肺与大肠相表里研究，中药理论研究，复方药理研究，治则原理研究等，述其要者均只是对中医已发现之经验，做出"从现代科学技术来看也是有道理的"这一说明。
　　对现代中医理论与经验不相吻合之处则认为不宜接受。如在证候实质研究中微观指标的低符合性一直是导致否认这一研究的重要理由，而不认为这正是理论超越经验的起点【4】。或是以"求同思维"，避而不谈。
　　这就使现代中医理论失去其理论意义，而成为经验之现代训诂。
三、中医理论的第二次主体型发展

　　1.所以现代中医理论的发展应建立主体性，从而使中医具有"大"理论特征而成为理论科学。
　　2.中医理论的主体型发展并非于今斯有。《内经》即是典型的第一次。《内经》的阴阳五行、精气神学说、脏象气血学说、经络模型、术数理论均直接移植自古代哲学【5】，这种移植所考虑