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1.本病是牙周炎向深部发展的一个阶段，茵斑微生物是其主要病因。只是由于根分叉区一旦暴露，该处的菌斑控制和牙石的清除十分困难，使病变加速或加重发展，不易控制。
2.合创伤是本病的一个促进因素。因为根分叉区是对合力敏感的部位，一旦牙龈的炎症进入该区，组织的破坏会加速进行，常造成凹坑状或垂直骨吸收。尤其是病变局限于一个牙齿或单一牙根时，更应考虑合创伤的因素。
3.牙根的解剖形态
(1)根柱的长度：根柱是指牙根尚未分叉的部分，其长度为从釉牙骨质界至两根分开处的距离。牙齿根柱长度的不同，说明牙根分叉的位置高度不同。根柱较短的牙，根分叉的开口离牙颈部近，一旦发生牙周炎，较易发生根分叉病变;而根柱长者则不易发生根分叉病变，但一旦发生则治疗较困难。
(2)根分叉开口处的宽度及分叉角度：牙根分叉的角度由第一磨牙向第二和第三磨牙依次减小。分叉角度和开口处的宽度越小，刮治器越难以进入分叉区内，病变越难控制。
(3)根面的外形：上颌磨牙的近中颊根和下颌磨牙的近中根均为扁根，向着根分叉的面常有犁沟状的凹陷，一旦发生根分叉病变，牙根上的沟状凹陷处较难清洁。
4.牙颈部的釉质突起釉突在多根牙的发生率约40%，多见于磨牙的颊面，，约13%的牙釉突伸进分叉区甚至到达根分叉顶部，该处无牙周膜附着，仅有结合上皮，故在牙龈有炎症时，该处易形成牙周袋。有人报道在患根分叉病变的磨牙中，59.2%有釉突，而健康的对照牙中仅9.8%有釉突。
5.磨牙牙髓的感染和炎症可通过髓室底处的副根管扩散蔓延到根分叉区，造成该处的骨吸收和牙周袋。
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