第十四条 进入隔离检疫区的牛,由认可兽医隔离观察7至10天。对无动物传染病临床症状并经驱除体内外寄生虫、加施耳牌后，方可转入育肥区饲养。认可兽医对进入育肥区的牛要逐头填写供港澳活牛健康卡(见附件5)，逐头建立牛只档案。
第十五条 耳牌应加施在每头牛的左耳上。国家检验检疫局统一负责耳牌的监制;注册育肥场所在地检验检疫机构负责耳牌发放与使用监督管理;注册育肥场认可兽医负责耳牌的保管与加施，并把耳牌使用情况填入《供港澳活牛检疫耳牌使用情况登记表》(见附件6)。耳牌规格为3cm×6cm，上面印有耳牌流水号(均为全国统一号)。耳牌上空白部分由检验检疫机构在发放耳牌时用专用笔标上注册育肥场注册编号。育肥场注册编号加耳牌流水号即为每头牛的编号。
第十六条 育肥牛在育肥场中至少饲养60天(从进场隔离检疫合格之日至进入出场隔离检疫区之日)，出场前隔离检疫7天，经隔离检疫合格方可供应港澳。
第十七条 注册育肥场、中转仓须保持良好的环境卫生，做好日常防疫消毒工作。要定期清扫、消毒栏舍、饲槽、运动场，开展灭鼠、灭蝇蚊和灭吸血昆虫工作，做好废弃物和废水的无害化处理。不得在生产区内宰杀病残死牛。进出育肥场、中转仓的人员和车辆须严格消毒。
第十八条 注册育肥场须按规定做好动物传染病的免疫接种，并做好记录，包括免疫接种日期、疫苗种类、免疫方式、剂量、负责接种人姓名等。
第十九条 注册育肥场、中转仓应建立疫情申报制度。发现一般传染病应及时报告所在地检验检疫机构;发现可疑一类传染病或发病率、死亡率较高的动物疾病，应采取紧急防范措施并于24小时内报告所在地检验检疫机构和地方政府兽医防疫机构。注册育肥场发生一类传染病的，应停止向港澳供应活牛，在最后一头病牛扑杀6个月后，经严格消毒处理，方可重新恢复其向港澳供应活牛。注册中转仓发生一类传染病的，在中转仓内的所有牛只禁止供应港澳，在清除所有牛只、彻底消毒21天后，经再次严格消毒，方可重新用于中转活牛。
第四章 检验检疫
第三十条 出口企业在供港澳活牛出场前7-10天向启运地检验检疫机构报检，并提供供港澳活牛的耳牌号和活牛所处育肥场隔离检疫栏舍号。受理报检后，启运地检验检疫机构应到注册育肥场逐头核对牛的数量、耳牌号等，对供港澳活牛实施临床检查，必要时实施实验室检验。
第三十一条 经检验检疫合格的供港澳活牛由启运地检验检疫机构签发《动物卫生证书》。证书有效期，广东省内为3天，长江以南其他地区为6天，长江以北地区为7-15天。
第三十二条 供港澳活牛运抵出境口岸时，出口企业或其代理人须于当日持启运地检验检疫机构签发的《动物卫生证书》正本向出境口岸检验检疫机构报检。如需卸入出境口岸中转仓的，须向检验检疫机构申报，经现场检疫合格方可卸入中转仓。来自不同的注册育肥场的活牛须分群栓养。来自不同省、市、区的活牛不得同仓饲养。
第三十三条 受理报检后，出境口岸检验检疫机构根据下列情况分别处理：
在《动物卫生证书》有效期内抵达出境口岸、不变更运输工具出境的，经审核证单、核对耳牌号并实施临床检查合格后，在《动物卫生证书》上加签实际出口数量，出具《出境货物通关单》准予出境。
在《动物卫生证书》有效期内抵达出境口岸、变更运输工具出境的，经审核证单、核对耳牌号并实施临床检查合格后，重新签发《动物卫生证书》，并附原证书复印件，出具《出境货物通关单》准予出境。
经检验检疫不合格的，或无启运地检验检疫机构签发的《动物卫生证书》或超过《动物卫生证书》有效期的、无检疫耳牌的，或伪造、变造检疫证单、耳牌的，不准出境。
第三十四条 出境口岸检验检疫机构如发现供港澳活牛有重大疫情，应立即上报国家检验检疫局，并向当地地方政府兽医防疫机构通报，同时通知相关检验检疫机构。
第三十五条 出境口岸检验检疫机构每月5日前应将上月各省、市、自治区供港澳活牛检验检疫数据和检疫中发现的有关疾病、证单、装载、运输等存在的问题书面通知启运地检验检疫机构。
第三十六条 检验检疫机构对供港澳活牛注册育肥场、中转仓实施检验检疫监督，定期检查供港澳活牛的收购、用药、免疫、消毒、饲料使用和疾病发生情况。监督检查结果分别填入《供港澳活牛育肥场监管手册》(见附件7)和《供港澳活牛中转仓监管手册》(见附件8)。注册育肥场、中转仓应按要求如实填写监管手册，并接受检验检疫机构的监督管理。
第三十七条 检验检疫机构对供港澳活牛注册育肥场、中转仓实施疫情监测，并指导免疫接种和传染病防治。
第三十八条 检验检疫机构根据情况可定期或不定期对注册育肥场、中转仓动物药物使用和管理情况进行检查，采集所需样品作药物残留检测。
第三十九条 检验检疫机构对注册育肥场、中转仓的饲料、饲料添加剂使用情况进行监督，必要时可取样检测饲料中病原微生物、农药、兽药或其他有毒有害物质的残留量。
第四十条 “供港澳活牛育肥场”是指将架子牛育肥成符合港澳市场质量要求的活牛的饲养场。“供港澳活牛中转仓”是指专门用于将供港澳活牛从注册育肥场输往港澳途中暂时存放的场所，包括在启运地的中转仓和在出境口岸的中转仓。