实行综合柜员制后的基层农发行会计部门岗位设置更加精简，分工也更明确，大体分为柜员(业务量大的支行通常设立两个)、综合员、坐班主任、营业部主任4个岗位，与传统的柜台制相比，每位综合柜员都有自己的IC卡和密码，独立操作业务。

然而，柜员制在提高服务效率的同时也提高了风险的发生率。

(1)临柜柜员的操作风险有所提高：柜员制下的交易处理流程与操作环节都进一步简化，部分业务在未达到规定上限时不需复核和授权，基本都是“一手清”，导致在整个核算过程中缺乏监控与监督，无法有效实行全盘的风险控制。

(2)综合柜员的工作任务有所加重：柜员制下，综合岗的工作包括日常的传票装订，会计档案保存，借据抵押物管理，以及特殊情况下的代班。由于农发行近几年的人员配备尚不充足，加之临柜柜员通常要求配备年轻人，很可能导致综合岗的柜员年龄偏大，在代班时出现业务知识不熟，电子设备不会使用的情况。

(3)坐班主任的监督职责有所扩大：改革以后坐班主任处于临柜业务的核心位置，对临柜业务全面把关，是风险控制的首要防线。然而，有的坐班主任职业道德不高，纪律性不强，对临柜柜员的工作未做到严厉把关，对自身的审核、授权工作也不到位;有的坐班主任人员素质参差不齐，业务能力有高有低，严重影响到会计部门的工作质量。  条件缺失导致管理难实行

农发行在成立的十几年间发展迅速，在取得成绩的同时，问题也日益凸显，反映在会计上主要表现为：长年来信息更新速度赶不上业务发展速度，配套设施不完善制约工作效率，规章制度不健全影响有效管理。

一方面，在基层农发行开户的企业特别是中小企业内部管理本身就存在漏洞，有的企业会计更换频繁，使得新会计到任后不能对农发行业务有较好掌握;有的企业出现换会计不换印鉴或者换印鉴不换会计等违规现象，使得银行在办理业务时无法有效监督。另一方面，有的企业在开户后并未发生业务或者业务发生量极少，转为久悬户后仍未作出处理，对账情况长期不能落实，这类情况严重影响到银企关系，特别是在农发行最近实行的账户年检及机构代码证发放时问题突出，使得会计管理工作难度加大。

会计制度难落实与配套设施难更新也是基层农发行会计工作面临的一大难题。例如岗位轮换与强制休假制度，在人员原本就不足的会计部门实施起来难度很大;最近实行的超过50万资金结算报备的规定也大多流于形式，没有达到有效管理资金的目的。另外，在信息更新速度异常迅速的今天，农发行综合柜面系统的升级长期处于停滞状态，会计部门的各类系统发展速度缓慢，由于系统原因产生的异常情况时有发生;尽管计算机、打印机等设备每年有更换，但维修升级服务不配套，导致固定资产价值无法最大化，也是会计管理上的一大忌讳。  监管不足管理缺乏外部压力

基层农发行会计部门的第一管理人为营业部主任，直接对会计业务、系统管理、经费账目负责，是一份综合性极强的工作，这就要求营业部主任具有相当高的职业道德与业务能力，具有总揽全局与判别形势的能力。然而，部分支行由于人员不足或者出于提高人员使用效率的目的，存在着由副行长兼任会计主管的情况，此时副行长担任着双重角色，工作任务加重，精力也容易分散。这种情况可能导致兼任者对兼任工作的重要性认识不足，产生把副行长当“主业”，把会计主管当“副业”的错误思路;或者将权力下放，部分工作由坐班主任代劳，这就在一定程度上扩大了会计操作的风险性。

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