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2015-09-18
微卫星DNA是一种非常活跃的碱基序列,广泛分布于各类真核生物基因组的不同位置,而且分布比较均匀,能参与遗传物质的结构改变,基因调控及细胞分化等过程,有自身特异性结合蛋白,还能直接编码蛋白质。微卫星基因序列中,重复基因的重复次数不同,且重复的基因序列不同,产生了简单序列长度多态性和随机扩增微卫星多态性,从而反映高度的等位基因多样性。由于微卫星位点两侧的DNA序列较为保守,根据两侧的这个保守序列设计特定的引物,并通过PCR扩增,将其间的核心卫星DNA序列扩增出来,结合聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,就可以对这些多态性进行比较分析。
SSR技术采用PCR进行检测,所需DNA样品量少,仅需微量组织,且质量要求不高,即使DNA部分降解,也能进行有效分析鉴定。SSR呈共显性遗传,可鉴别杂合子和纯合子,且多态性丰富,每个位点均有许多等位形式,重复性好,结果稳定可靠[7]。SSR技术既有RFLP技术的稳定性和共显性的优点,又比RAPD标记成本低,技术简单,是目前较受欢迎的分子标记技术。
由于SSR标记以孟德尔方式遗传,呈共显性的特点,利用杂交种亲本在某些SSR位点的差异,就可以将亲本与杂交种区分开。到目前为止,SSR技术已在多种农作物种子的品种纯度鉴定中得到应用。
玉米是我国的主要农业作物,利用SSR技术进行玉米种子纯度鉴定,已经筛选出多对可利用的引物,综合运用SSR核心引物和DNA指纹图谱,可以准确地鉴定父本、母本、混杂品种及真实杂交种,其鉴定结果与RFLP结果及系谱来源基本一致。有关的报道:李新海,袁力行等[8]利用SSR标记研究了70份我国主要玉米自交系的遗传变异,用64对扩增带型稳定的引物,从供试材料中测出248个等位基因变异,将70份自交系划分为6个类群,划群结果与系谱分析与育种家经验相符。番兴明,陈洪梅等[9]利用SSR标记将我国温带玉米主要杂种优势群的4个标准测验种和5个热带玉米25个典型自交系划分为4个类群,结果与系谱来源基本一致。Smith等[10]报道了用131对SSR引物对58个玉米自交系的划群结果与RFLP结果基本相同。
编辑老师在此也特别为朋友们编辑整理了SSR标记技术在种子纯度鉴定中的研究。
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